En la temporada 2003-04, Míchel fue renovado y dirigió al Club Deportivo As Pontes en Tercera División, hasta su dimisión en mayo de 2004.
En enero de 2009, inició su segunda etapa como técnico la SD O Val, esta vez en la Primera Autonómica.
Tras tres temporadas en la Tercera División de España, al término de la temporada 2013-14, lograría el primer puesto del grupo I y posteriormente, el ascenso a la Segunda División B de España.
En la temporada 2014-15, dirigiría a la UD Somozas en la Segunda División B de España, acabando en décima posición del campeonato.
En la temporada 2017-18, regresa a la UD Somozas, tras su reciente descenso a la Tercera División de España, con el que acaba en sexta posición en el Grupo I.