Actualmente el club cuenta con 13 equipos de diferentes categorías, 228 deportistas inscritos, 19 entrenadores y 325 socios.

Hasta ese momento, ésta fue la campaña más brillante del club, que tenía como entrenador Enrique Sáez.

Unos años más tarde, en la temporada 1999-00, nuestro equipo disputó la liguilla de 1ª regional.

El primer equipo militaba en la liga regional preferente pero sin conseguir éxitos destacados.

El 2 de septiembre de 2007, una gestora se tuvo que hacer cargo del club hasta que se convocaran unas elecciones para elegir un nuevo presidente y una nueva junta directiva.

Felip Portes asumió la presidencia del club, que en ese momento estaba prácticamente hundido.

La dedicación altruista, pero muy profesional, que hace ver la Dirección se basaba en conseguir el éxito deportivo, social y económico.

Se fichar varios jugadores que hicieron aumentar el nivel competitivo del nuevo Formentera.

En la liga regional de Ibiza y Formentera nuestro equipo, reforzado con los nuevos fichajes, no tardó en dar buenos resultados.

El primer gran éxito deportivo de la nueva directiva llegó a la temporada 2011-12.

Lo cual significó el ascenso directo de la SD Formentera a Tercera División.

También se ficha nuevos jugadores para formar un equipo con garantías de mantenerse en la categoría autonómica.

Quedó tercero en la liga y se clasificó por primera vez en la historia en una eliminatoria de ascenso a Segunda B.

A pesar de haber perdido, la afición estaba absolutamente al lado del equipo y se tomó esta eliminatoria como una fiesta, ya que casi nadie se imaginaba que la primera temporada en Tercera, en la época actual, el equipo tuviera aspiraciones de ascender a Segunda B.

Esta vez la SD Formentera llegó aún más lejos que la temporada pasada.

A partir de aquí la imagen del Formentera ya era mucho más sólida.

Ahora ya sí era un equipo potente y con posibilidades de hacer grandes cosas en el fútbol.

Los aficionados estaban eufóricos y la Junta Directiva se emocionaba por el trabajo realizado.

Tocó el Peña Sport, de Tafalla, un rival muy duro que ganó la eliminatoria.

Por tanto, el sueño de llegar a segunda B estaba cada vez más cerca.

En la temporada 2016-17 llegó la felicidad más grande que la afición de Formentera ha vivido nunca.

No solo para que el proyecto deportivo sigue adelante, sino porque ahora ya es una posibilidad real de subir a Segunda B, acumulando cuatro eliminatorias de ascenso consecutivos a esta categoría.

En la ida, la SD Formentera ya se sacó medio billete a Segunda División B.

Logró ascender a la categoría de bronce del fútbol nacional por primera vez.

Sin embargo, los locales no supieron derribar el muro defensivo que se encontraron enfrente encarnado por un Formentera solvente atrás que supo contener las constantes llegadas de su adversario a base de fe y oficio.

Pero debido a que el primer equipo; el Real Mallorca, ya estaba clasificado para la Copa, no fue posible que dos equipos de un mismo club participen en esta competición.

Una vez más el Formentera hacía historia y terminó aquella tanda ganando (10-9).

Los socios y aficionados que no se pudieron desplazar a Tudela, siguieron el partido por la televisión.

Detuvo dos penales de los navarros y se consiguió así una victoria histórica para el club (3-4).

Esta victoria no sólo significó que el Formentera se convirtiera en un equipo mediático a escala nacional, sino lo más importante; jugar la siguiente eliminatoria contra un equipo de Primera División y que estuviera jugando en competiciones europeas.