[2] En Borja el maestro tuvo numerosos problemas y el cabildo lo reconvino en varias ocasiones.
Al parecer no cumplía con sus obligaciones, tanto en cuanto a su participación en actos públicos con hábito de coro, como en cuanto a la educación de los infantes del coro, siendo multado con penas pecuniarias.
A comienzos de 1663 se despidió del cargo por «unos disgustos que había tenido», siendo sustituido por Bartolomé Longás.
Esta segunda etapa pasó sin incidentes y con buenas relaciones con el cabildo.
En octubre de 1678 se despidió del cargo para regresar a su ciudad natal.