Finalmente, Sayer fue liberado por las autoridades, debido a la presión ejercida por el grupo comandado por Riel padre.
Al volver, sin embargo, Riel observó que en el lugar estaban creciendo las tensiones religiosas, nacionalistas y raciales, debido a la inmigración de familias anglófonas protestantes.
Aun así, el coronel McDougall, que hablaba sólo inglés, fue elegido vicegobernador de los Territorios del Noroeste.
Schultz, sin embargo, conseguir atraer a cerca de 50 reclutas, con los que fortificó su casa y su tienda.
Boulton fue juzgado en un tribunal liderado por Ambroise-Dydime Lépine, y condenado a muerte por su interferencia en el gobierno provisional.
En su juicio, Scott fue condenado a muerte, acusado de desafiar la autoridad del gobierno provisional.
Los delegados que representaban al gobierno provisional de los métis partieron a Ottawa en marzo.
Aunque en un principio tuvieron dificultades legales, dada la ejecución de Scott, se les permitió inmediatamente negociar con Macdonald y George-Étienne Cartier.
Ahora, la comunidad de Red River se enfrentaba con otra amenaza, esta vez estadounidense: ataques fenianos coordinados por William Bernard O'Donoghue.
Con las elecciones federales en 1872, Macdonald no podía permitirse más desavenencias en las relaciones entre Ontario y Quebec.
Ya que tenía pocas opciones disponibles, Riel aceptó la oferta y llegó a St.
En las elecciones siguientes (para la elección de un miembro del parlamento que sustituyera a Cartier), celebradas en octubre de ese mismo año, Riel venció sin oposición, aunque fue forzado una vez más a huir, pues había una orden gubernamental de septiembre que pedía su encarcelamiento.. Lépine no tuvo la misma suerte: fue capturado y después juzgado.
Aunque los liberales y Mackenzie vencieron, Riel consiguió mantener con facilidad su escaño en la Cámara de los Comunes.
Durante este tiempo de exilio, estuvo dominado por las cuestiones religiosas más que por las políticas.
Biógrafos modernos especulan que Riel podría haber sufrido un desorden psicológico llamado megalomanía.
Sin embargo, ella decidió que la vida en los campos aislados del interior no era de su estilo, y su relación acabó.
Como muchos otros Métis que abandonaron la comunidad y Manitoba, Riel se dirigió al oeste con el propósito de comenzar una nueva vida.
Los métis fueron obligados a dejar de cazar, y en su lugar, tuvieron que practicar la agricultura para subsistir.
Esto llevó a un deterioro en sus relaciones con la Iglesia católica (Riel, en sus discursos públicos sobre religión, apoyaba abiertamente una doctrina herética).
La situación en la región se había vuelto crítica, y el 23 de marzo, Dewdney envió un mensaje vía telégrafo a Macdonald, en el que le informaba de que quizá pudiera ser necesaria una intervención militar.
Riel creía que el gobierno de Canadá no sería capaz de responder eficaz y rápidamente a otra revuelta en los distantes y aislados Territorios del Noroeste, forzándole a que estableciera negociaciones políticas.
Sin embargo, Riel no sabía, o ignoraba por completo, la existencia de la Canadian Pacific Railway, que estaba construyéndose entre Vancouver y Montreal.
El primer ministro John Alexander Macdonald ordenó que el juicio se realizara en Regina, donde Riel fue juzgado por un jurado compuesto por seis protestantes ingleses y escoceses, todos de la región de Regina.
Cincuenta años después, Edwin Brooks, un miembro del jurado, dijo que Riel fue juzgado por traición y ahorcado por la muerte de Thomas Scott.
En el tiempo que precedió a su ejecución, Riel se reconcilió con la Iglesia católica, y tuvo como consejero espiritual al Padre André.
También se le proporcionó material de escritura, por lo que Riel pudo emplear su tiempo en prisión para escribir un libro.
Se reitera nuevamente que, hasta entonces, Saskatchewan aún formaba parte de los Territorios del Noroeste (pasaría a ser provincia en 1905).
En las elecciones federales de 1887 también hubo grandes cambios, pues el Partido Liberal de Canadá, bajo el liderazgo del quebequense Wilfrid Laurier, consiguió un gran ascenso, a costa del Partido Conservador.
Si Riel no hubiera asesinado a Scott, tal vez el gobierno de Canadá hubiera sido más riguroso en la supervisión de tal programa, dadas las buenas relaciones entre Canadá y los Métis hasta ese momento.
Además, la autopista provincial 11, que conecta Regina con Prince Albert fue bautizada Louis Riel Trail, por el gobierno de Saskatchewan.