Volvió a París en junio del año siguiente y llevó una vida solitaria.En 1885, Janmot se casó con una antigua alumna, Antoinette Currat, y volvió a establecerse en Lyon.En su pintura, el dibujo y el acabado de Ingrès se combinan con un misticismo cuyo paralelo remite a la obra de sus contemporáneos del movimiento nazareno o a los prerrafaelistas.Janmot está considerado como un artista de transición entre el romanticismo, el simbolismo y el prerrafaelismo.Su obra fue admirada por Puvis de Chavannes, el bordelés Odilon Redon o Maurice Denis.Su obra maestra es El Poema del alma, conjunto formado por 18 cuadros y 16 dibujos que le ocupó durante más de cuarenta años, entre 1835 y 1880.Un largo poema compuesto por Janmot le sirve de argumento a los cuadros.Escribió a tal efecto un poema cíclico cuya primera parte fue publicada en 1854 en Lyon por el editor Vingtrinier.