Regresó a Bryn Mawr en 1892, donde recibió su maestría en biología en 1894, dirigida por Thomas Morgan.
Ella mantuvo esta casa por muchos años, eventualmente equipándola para lecciones de ciencia para niños.
Con varias mujeres, Morgan fundó el club escolar de verano en Woods Hole en 1913, el cual es ahora la escuela de ciencia para niños, y sirvió como su primer presidente educativo y presidente del comité científico en 1914.
Ella prefería trabajar al aire libre con los niños para llevar a cabo experimentos y discutir problemas.
Su esposo y los otros científicos nunca estuvieron cómodos con su presencia en el laboratorio, cuya atmósfera era "un poco como el de un club exclusivo para hombres."
Estos compuestos son transmitidos como una sola entidad exclusivamente de madre a hija.