La liga comienza con el Clasificatorio, donde cada equipo deberá jugar contra todos sus rivales dos veces, una oficiando de local en su cancha y otra de visitante.

Terminada esta fase, pasarán a la próxima ronda los 10 primeros equipos, los tres últimos equipos de la tabla pertenecientes a Montevideo y uno del interior si se encuentra entre los últimos cuatro, descenderán de categoría, en el caso de los equipos de Montevideo para jugar el Torneo Metropolitano 2006, mientras que el del interior volverá al Torneo Regional.

Culminada esta fase dos equipos quedarán eliminados y ocho serán los que jueguen los play-offs.

Los vencedores pasaran a semifinales jugadas al mejor de siete a diferencia que en la etapa anterior esta vez se tendrán en cuenta los resultados de la Segunda fase.

Tras esta etapa quedaron diez clasificados, tres eliminados (que estarán en la Liga 2006-07) y tres descensos, los de Cordón, Bohemios y Welcome