En sus inicios los clubes fundadores fueron 15,[2]​ pero con los años entre altas y bajas, fueron sumándose más clubes hasta llegar al número actual de 21 equipos, con esta cantidad de equipos fue necesario crear una divisional de ascenso, equivalente a una quinta división del fútbol paraguayo.

Este sistema de dos divisiones fue utilizado por varias décadas hasta el año 2015.

[10]​[11]​ A finales del 2018 los clubes decidieron volver a dividir en campeonato en dos divisiones (Primera y de Ascenso), así que se estableció disputar con este formato en el periodo de 2019 - 2022.

Pero debido a la pandemia de COVID-19 la SuperCopa 2020 pudo disputarse recién en el 2021.

En el 2017 la Liga organizó su primer campeonato oficial de fútbol femenino, en ese primer campeonato participaron 14 clubes, siendo los primeros finalistas los clubes San Pedro y 13 de junio (Reducto).

[44]​ La Selección Sanlorenzana es el equipo que representa a la Liga en el Campeonato Nacional de Interligas.