La Liga Femenina 2 fue la competición que adoptó el cambio más grande en cuanto a formato con la ampliación en número de equipos debido a la pandemia de COVID-19, hasta un total de 42 clubes divididos en tres grupos de competición.

Para la Fase Final se clasificaron los 4 mejores equipos de cada uno de los 3 grupos, con los que se formaron 4 grupos de 3 equipos mediante sorteo.

Los dos ascensos a Liga Femenina los jugaron los primeros clasificados de cada grupo (1A vs 1B y 1C vs 1D).

La principal novedad es la creación para la temporada 2021-22 de una nueva categoría denominada Liga Femenina Challenge en el segundo nivel del baloncesto femenino y que pasará a estar integrada por 16 equipos: los dos equipos que desciendan de Liga Femenina; los 10 equipos que jueguen la Fase Final de la Liga Femenina 2 2020-21 pero no logren el ascenso; y los 4 siguientes mejores equipos clasificados al término de la Liga Regular que no hayan participado en la Fase Final.

Todos los partidos se juegan en una misma sede, a ser designada por la Federación Española de Baloncesto.