Los equipos serán divididos en 4 grupos dependiendo la distribución geográfica y la conectividad donde se ubique cada club.
Los 16 equipos clasificados desde la fase regular avanzaran a la fase final en el cual serán agrupados en 4 grupos de 4 equipos cada uno donde se jugarán 6 fechas por grupo de ida y vuelta cada uno.
Los 1º y 2º de cada grupo (8 en total) avanzarán a la play-offs del torneo.
Definirá al campeón que asciende a la Liga 2.
El sub campeón deberá definir su ascenso a liga 2 en un partido de repechaje con el subcampeón de la Copa Perú del año 2025.