Fue fundado en 1978 y desde 2025 jugará en la Liga 3, la tercera categoría del fútbol nacional.

[1]​ Sin embargo, no pudo superar la fase de grupos y quedó eliminado.

Empezó su participación en 2018 desde la División Superior de Piura donde fue subcampeón y clasificó nuevamente a la Etapa Departamental.

[5]​ Fue eliminado por Defensor La Bocana que le venció tanto en la ida como en la vuelta y se quedó con el cupo a la Etapa Nacional.

Juventud Cautivo mantiene una rivalidad a nivel local con el club San Pedro, representante también del sector de Pampa Alegre.