Mostró talento como entrenador cuando comandó los tres grandes clubes del fútbol paranaense: Atlético Paranaense, Coritiba y Paraná, habiendo destacado-si nacionalmente cuando dirigió el Crucero, con el cual sagrou-si campeón de la Copa de Brasil de 1996 venciendo el badalado equipo del Palmeiras.
El año siguiente, Levir fue contratado por el Botafogo, equipo que fue escariado junto con el Palmeiras en 2002.
Esta será el cuarto pasaje de Levir Culpi por el club minero.
En 2015, luego en la primera partida oficial de la temporada, victoria atleticana por 2 a 0 sobre el Tupi, Levir llegó al juego de número 228 al frente del equipo alvinegra, haciéndose el tercer entrenador con más juegos por el club.
Con la nueva marca, el entrenador queda atrás sólo de Telê Santana con 434 juegos, y Procópio Cardoso con 328.