Alcanza una concentración máxima en el humor acuoso 2 horas después de su administración.

Por ello se recomienda su aplicación únicamente una vez al día.

En personas intervenidas de catarata a las que se le había extirpado el cristalino y sustituido por una lente intraocular, se han producido en ocasiones casos de edema macular.

[1]​ Entre los fármacos que comparten con el latanoprost su acción reductora de la presión intraocular, se encuentra el travoprost, el tafluprost, bimatoprost el timolol, la brimonidina y la pilocarpina.

También existe la fórmula de latanoprost sin conservantes Estudios recientes parecen demostrar que a diferentes concentraciones puede servir para combatir la alopecia androgénica.