Luego de una carrera militar hasta 1852, se decide a dedicarse a la Historia natural, habiéndose dado la baja del Ejército como 1.er.

En 1861, publica sus observaciones de insectos y de vertebrados en Bidrag til Kundskab om Brasiliens Padder og Krybdyr, con Johannes Theodor Reinhardt (1816-1882).

Obtienee un puesto en la "École polytechnique" en 1877, y, cuatro años más tarde deja la universidad.

Fue miembro de la Zoological Society of London en 1879.

La abreviatura Lutken se emplea para indicar a Christian Frederik Lütken como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.