La "W" en este modelos hace referencia a otros modelos de la empresa fabricados entre 1967 y 1975 (Kawasaki serie W, W1, W2 y W3) En Estados Unidos y Canadá la W650 se importó desde 1999 hasta 2006.
Con poco éxito comercial en los dos países y con la introducción de la Triumph Bonneville también de aspecto retro hizo que las ventas de esta moto se centrasen en Europa donde se vendió hasta 2008 y Japón donde se vendió hasta 2009 año en el que cesa su producción.
En 1999, después del éxito conseguido con el modelo Zephyr también de estilo retro, Kawasaki produjo la W650, con modernas tecnologías como un árbol de equilibrado para disminuir las vibraciones, equipo eléctrico moderno, y árbol de levas en cabeza con engranajes cónicos.
Este árbol de levas es el primero desde el período entre 1972 y 1980 en que Ducati lo usó en sus motores bicilíndricos en uve.
Por ello puede haber sido la primera que incorporó este sistema en un motor bicilíndrico paralelo.