[1]​ En 1841 se traslada a Giessen, para continuar sus estudios bajo la dirección de Justus von Liebig, donde trabajó como asistente en el laboratorio de Liebig, que es un gran educador y ejerce una influencia profunda sobre Fresenius.

Como científico, Fresenius se dedicó casi exclusivamente a la química analítica, siendo autor de varios tratados sobre análisis cuantitativo y cualitativo en los que detalló un método basado, casi exclusivamente en sus propias experiencias, en la separación de cationes en grupos, método conocido como marcha analítica.

Su primer libro sobre este aspecto de la Química Analítica llevó por nombre “Anleitung zur qualitativen chemischen Analyse” ("Instrucciones para análisis químico cualitativo") y fue publicado durante su estancia en la Universidad de Bonn, en 1841.

A esta primera edición siguieron varias más, donde se incluyeron algunas modificaciones y mejoras en las pruebas analíticas.

En 1844, apareció la tercera edición, con importantes cambios sobre las anteriores, que prácticamente se han mantenido sin modificaciones hasta nuestros días.