[2]​[3]​ Juanjui posee un clima cálido y húmedo, con temperaturas que van desde los 23 °C (70 °F) a 36 °C (97 °F).

Juanjui se ubica en la parte casi central de la Región San Martín.

Para testimonio de valor de esta raza que no se sometió al imperio del Tahuantinsuyo están el Gran Pajatén, Cóndor Sarca, Tocache Viejo, Ochanachi, Pampa Hermosa, Achiras Sion, Alto Juñao, Valle Viejo, Pajatén, Balsayacu y Cartagena.

A la llegada de los misioneros españoles a San Martin, las poblaciones nativas estaban organizados en tribus que vivían dispersos y aislados en zonas geográficas bastante amplias.

Juanjui emergía con grandeza y pronto llegó a convertirse en un caserío ejemplar de Pachiza.

Juanjui, al igual que Pachiza, es considerado como anexo del distrito de Saposoa, que a la vez pertenecía a la extensa Provincia del Huallaga, cuya capital era Tarapoto.

Lo que en un principio fue una guerra epistolar entre los hijos de Juanjui y Saposoa se truncó en conflagración bélica.

(Alcalde desde 1938, al momento cuando se crea la provincia en mayo de 1940, él era alcalde distrital, y por ende ya con la nueva provincia, sien embargo en la ceremonia oficial realizada el 02 de julio del mismo año, Tomas Pestana Aguirre era reconocido como el primer alcalde en presidir dicho acto histórico, por lo que su periodo culmino en 1942.)

: Dr. Mauro Paz Moreno (Si está ceremonia se llevó a cabo el año 1940, entonces la información con respecto al director de la GUE, Carlos Wiesse y de la directora del colegio Inmaculada, es falsa, pues estás instituciones se crearon muy posteriormente, la GUE en 1957 y la Inmaculada en 1963) Espero sirva mi información.

Por los años de 1950 – 1960 en las gestiones como Senador Don Víctor Manuel Arévalo y como Diputado el Sr. Grimaldo Reátegui Weninger, se dieron la inversiones por parte del estado, a favor de la provincia.

Esto produjo efectos muy favorables a la provincia, produciéndose conexión entre la costa y la sierra, motivando una fuerte migración cajamarquina.

Terrestre: Carretera Fernando Belaúnde Terry que une a la ciudad por el Norte con las ciudades de Bellavista, Tarapoto, Moyobamba, Rioja, y que la conecta hasta la Región Lambayeque en la costa peruana.

Sin embargo, el aeropuerto recibe vuelos particulares y militares en dependencia de la ocasión.

Fluvial: Cuenta con varios puertos o desembarcadero denominados Puerto Amberes, Puerto Conchán, a orillas del Río Huallaga donde parten y arriban muchas embarcaciones con gran actividad comercial entre diversos centros poblados de corta, mediana y larga distancia desde Juanjuí.

El primer lugar es para Miss Juanjui (Algunos años cambia de formato a "Srta.

Existe en la ciudad concursos de menor categoría como Miss Naranja que se realiza al celebrase el festival del mismo nombre.