Además, tuvo una formación de pintor fuera de la rigidez del academicismo, tomando como referencias José María Velasco, Gerardo Murillo (Dr. Atl), Frida Kahlo y Diego Rivera.

En su carrera como arquitecto, trabajó en grandes proyectos tales como el nuevo edificio del Banco de México y diseñó/construyó 26 escuelas primarias en la Ciudad de México.

El funcionalismo en México de acuerdo con Juan O'Gorman tuvo dos tendencias que fueron la integralista que es lo útil, lo estético, lo lógico y lo social que son los valores independientes que suponen el valor de lo arquitectónico y uno de sus defensores fue el arquitecto José Villagrán García y después esta la otra tendencia que se llama radical y esta se preocupa por satisfacer las necesidades básicas y optimizar recursos económicos en la construcción en donde se prioriza la utilidad de la obra.

[4]​ Como pintor, destacan las obras donde plasmó en espacios públicos pasajes históricos y hechos diversos bajo un estilo particular, donde agrupaba en un momento personajes y hechos relacionados al tema de la obra, como lo hizo en los muros del Museo Nacional de Historia en el Castillo de Chapultepec, en el Aeropuerto Internacional de la Ciudad de México con La conquista del aire por el hombre o en el mural El crédito transforma a México, recién trasladado a la Torre HSBC.

Existen tres versiones de su suicidio y probablemente las tres sean ciertas; primero realizó una mezcla con las pinturas con las que realizaba sus murales y se la bebió, se colgó de un árbol y posteriormente se dio un disparo con su escopeta en la sien para finalmente caer ahorcado del árbol; con él se extinguia el movimiento del muralismo mexicano del siglo XX.