Juanjo se formó en las categorías inferiores del Real Murcia.
Acto seguido se fue a las filas del Real Jaén, Lorca, La Roda, Nástic de Tarragona y Melilla.
Tras dos temporadas en el Cádiz CF, en enero de 2017 el lateral regresaría a casa para jugar en el Real Murcia.
Durante la temporada 2017-18, jugaría en las filas del CF Lorca Deportiva y en la siguiente campaña la jugaría en el Club Deportivo Badajoz del Grupo IV de Segunda División B. Comenzaría la temporada 2019-20 en las filas del Club Deportivo Guijuelo del Grupo II de Segunda División B y en el mercado de invierno, reforzaría al Internacional de Madrid del Grupo I de Segunda División B.
En junio de 2020, el 'Pájaro' como le apodan, regresa a la Región de Murcia tras su pasos anteriores por el Real Murcia y el Lorca Deportiva.