Juega en el Grupo XIV de la Tercera Federación, quinta categoría del fútbol español.

[7]​ Un año después la nueva sociedad adquirió los derechos sobre el escudo, la marca y el distintivo histórico del Club Deportivo Badajoz para revivir así su nombre original y señas de identidad, así como los trofeos y resto de bienes en subasta pública,[8]​[9]​[10]​[11]​[12]​[13]​ previa a la liquidación de la Sociedad Anónima Deportiva Club Deportivo Badajoz (club con el número federativo 1001[14]​ fundado en 1905, extinto en 2012 y extinguiendo su personalidad jurídica en 2016).

El proyecto tenía como misión dar continuidad al CD Badajoz, desaparecido mercantilmente pero no sentimentalmente, con un nuevo proyecto basado en la práctica del fútbol en sus categorías inferiores masculinas y femeninas como forma de transmisión de los valores del club: humildad, hermandad, esfuerzo, nobleza y deportividad y su unión total con la ciudad.

La acogida del nuevo proyecto por parte de la ciudadanía pacense en la primera temporada resultó un éxito superando la cifra de 1977 abonados, lo que desbordó las expectativas iniciales e hizo que el recinto cedido por el Ayuntamiento para la celebración de sus partidos con aforo para 800 espectadores se quedase pequeño.

En la primera eliminatoria se midió al Aceuchal, venció por 3-4 en aquella localidad y cayó derrotado en casa por 1-2; merced al valor doble de los goles en campo contrario pasó la primera eliminatoria; quedó emparejado en la segunda ronda contra la Unión Cultural La Estrella.

En los tres años que duró su travesía por la Tercera División, consiguió clasificarse para todas las promociones de ascenso.

En la siguiente campaña también fue eliminado en primera ronda, esta vez por los gallegos del Club Deportivo Choco por un resultado global de 4-3.

Ya en la temporada 2016-17 se produjo el ansiado ascenso a Segunda B, tras superar en las tres eliminatorias de la promoción al Bergantiños Fútbol Club, al Antequera Club de Fútbol y finalmente al campeón del grupo riojano, el Club Deportivo Calahorra con Juan Marrero como entrenador, con goles de Ruano y Joaqui Flores.

Pero una gran segunda vuelta que incluyó siete victorias consecutivas en el tramo final llevaron en volandas al equipo hasta la clasificación para la promoción de ascenso a Segunda División 15 temporadas después.

Finalmente dos goles más de los riojanos les otorgó la clasificación para esa eliminatoria.

El Club Deportivo Badajoz que no había perdido en toda la temporada en su estadio, con su afición y con un empate le hubiera sido suficiente para ascender pero cayó derrotado por 0-1 en una noche aciaga para la parroquia blanquinegra.

[24]​ Con el presidente en la cárcel, el club se vio obligado a afrontar la temporada 2021/22 con serios problemas económicos que cada vez irían a más al no haber nadie que aportase el dinero necesario para pagar las nóminas de jugadores y cuerpo técnico, esto provocó que en mayo de 2022, mientras aún se negociaba la venta de la propiedad, el conjunto blanquinegro entrara en preconcurso de acreedores.

[31]​ En su debut lograría la victoria por 2-1 ante la AD Ceuta F. C.[32]​ y más adelante lograría triunfos como la victoria por un gol a cero ante el Deportivo de La Coruña,[33]​ pero con el paso de las jornadas los buenos resultados volverían a empezar a escasear y tras dos meses sin conocer la victoria el técnico almeriense sería el segundo técnico de la temporada en ser despedido[34]​ dando paso a David Tenorio que tendría la labor de sacar al equipo del descenso.

[36]​ En la siguiente temporada, ya en Segunda Federación y con una gran renovación de la plantilla, el equipo no daría mejores sensaciones.

[37]​Habría que esperar a la quinta jornada para ver la primera victoria del Badajoz, ante la U. D. San Fernando por 1-0.

[38]​Los malos resultados llevarían a que David Tenorio fuera cesado el 15 de octubre, llegando en su lugar Iñaki Alonso.

En la temporada 19/20 se consiguió el récord de abonados (9.200) y la mayor entrada de la historia del Badajoz como local (15.000 espectadores en Copa del Rey ante el Granada CF).

Por otro lado, existe una fuerte rivalidad con el AD Mérida, equipo de la capital autonómica y heredero del desaparecido CP Mérida frente a quien disputa el derbi provincial por excelencia en la región de Extremadura.

Fuera de la región extremeña tiene una rivalidad menor con el Córdoba CF.

Eran tradicionales las convivencias entre ambas aficiones previas a los enfrentamientos directos y era frecuente que acudieran a animar al estadio del equipo vecino seguidores del otro club en partidos de play-off o choques importantes.

En sus inicios el campo pacense disponía de capacidad para 1000 espectadores, posteriormente se incrementó hasta las 5000 localidades definitivas, aunque se llegaron a registrar entradas de 13 000 espectadores.

En 1998, ante la proximidad del primer centenario de vida del club pacense y tras varios años en Segunda División, las exigencias de un equipo candidato al ascenso a Primera División hicieron necesarias unas instalaciones más modernas y funcionales acorde con un proyecto con mayor ambición.

Desde la fundación del club en 2012 han vestido su camiseta más de doscientos futbolistas, siendo David Gascón Cordero el máximo goleador de la historia del club con 113 goles en las cuatro temporadas que disputó en el conjunto pacense logrando además 49 goles en 22 partidos en la temporada 2012-13 en Segunda División Extremeña.

[49]​ El equipo adopta la denominación de Badajoz Promesas como homenaje al nombre que adoptó el equipo filial del Club Deportivo Badajoz previamente a su constitución como Sociedad Anónima Deportiva.

El Femenino Badajoz sigue contando actualmente con equipos de cantera en las diversas categorías del fútbol femenino en las que compite con la equipación oficial con los colores blanquinegros y el escudo del CD Badajoz.

Segunda Federación 2023-24 (Grupo V) En el actual Museo del Club se puede contemplar los trofeos de toda la historia blanquinegra en sus distintas etapas.