En el año 2008 presentó una demanda civil por vulneración de su derecho al honor contra Pedro J. Ramírez, Casimiro García-Abadillo, Fernando Múgica Goñi y Federico Jiménez Losantos; director, vicedirector, redactor jefe y columnista del diario El Mundo, respectivamente, estos habían publicado informaciones donde le acusaron de haber prestado falso testimonio ante el juez[7].[8] También presentó una querella criminal[9] contra Federico Jiménez Losantos por las opiniones vertidas en su programa radiofónico en la Cadena COPE.[10]En ambas sentencias, el juez estimó que la libertad de expresión y el interés público del tema amparaba las noticias publicadas, sin entrar en la veracidad de las mismas.(2008) avalaron las actuaciones de los TEDAX en cuanto al tratamiento dado a los vestigios recogidos en los trenes[12].En 2014, publicó un libro titulado Las Bombas del 11 M. Relato de los hechos en primera persona,[15] con 37 documentos oficiales y varias referencias al sumario judicial, a la sentencia de la Audiencia Nacional[16] y a otras fuentes primarias, en las que refleja la correcta actuación de los TEDAX.