Sin embargo, había prometido antes el principado de Pomerania.

Bajo la Paz de Brudersdorf, Pomerania se le permitió mantener Rügen, pero tenía que pagar a Mecklemburgo 31.000 marcos de plata en compensación.

Desde 1350, abandonó los negocios del gobierno a su hijo y cogobernante Nicolás IV.

Juan III se casó en 1317 con Matilde (m. h. 1332), la hija del duque Otón I de Pomerania.

Tuvieron tres hijos: Después de la muerte de Matilde, Juan III se casó con Ricarda y tuvo dos hijas más: