Fue introducido al negocio del narcotráfico por su tío Fabio Restrepo Ochoa, quien le encomendó la distribución de droga a él y sus hermanos en Estados Unidos encubiertos como estudiantes.
Luego de los incidentes en Estados Unidos, junto con sus hermanos se asoció con Pablo Escobar y otros para conformar el cartel de Medellín.
Tras el secuestro de su hermana Marta Nieves Ochoa, se fundó por parte de los narcotraficantes del cartel de Medellín el grupo MAS que lideró una violenta guerra contra las guerrillas del M-19 y posteriormente contra otros grupos de izquierda, siendo este el germen del paramilitarismo en Colombia.
En 1991 Juan David se entregó a la justicia, junto con sus hermanos recibiendo los beneficios que otorgó el gobierno de Cesar Gaviria Trujillo.
Fue recluido en la cárcel de Itagüí, y dejado en libertad en 1996 tras un acuerdo con la fiscalía.