Sus padres fueron Colomba y Luis Scalabrini, tenía además 7 hermanos.Existía necesidad financiera en la familia, dos de sus hermanos tuvieron que migrar a América; la mayoría de las personas que vivían en su pueblo migraron a Suiza para trabajar en el campo.Su hermana Luisa fue la que más le ayudó en cuestión de pastoral a Juan Bautista tanto en el instituto parroquial que fundó como en el orfanato más adelante.Rápidamente se distinguió por su gran desempeño en los estudios, sus compañeros se admiraban cuando él compartía algunos temas, siempre fue el más aplicado de su clase desde que entró hasta que terminó sus estudios.El pueblo donde se ubicaba la parroquia sufría mucho a causa de la sobreexplotación laboral y los malos salarios que recibían.Scalabrini dio algunas conferencias que trataban acerca de los contenidos de constituciones eclesiales como la Dei Filius que trata de la fe y sobre la constitución, Pastor Aeternus, que habla del primado e infalibilidad del sumo Pontífice.