Al año siguiente, y como consecuencia de la crítica situación de Catamarca ante la invasión rosista, tuvo que abandonar la provincia junto a sus hermanos Marcelino y Uladislao.
Juan Agustín se radicó en Salta, Marcelino lo hizo en Tucumán y Uladislao regresó a Catamarca enseguida, radicándose en Andalgalá.
Su tía (hermana de su madre), Serafina Hoyos Torres, contrajo matrimonio con el general Juan Antonio Álvarez de Arenales.
Juana Hoyos Torres pertenecía a una de las primeras familias radicadas en Salta desde su fundación.
Desde allí mantuvo informado asiduamente al Presidente Mitre sobre la situación política provincial.