[1]​ Se desempeñó como capellán del ejército realista comandado por Mateo Musitu en Chiautla de la Sal.

Sin embargo decidió pasarse al bando de los insurgentes siendo nombrado vicario castrense.

Dos meses más tarde, Morelos le encargó fundar y dirigir el periódico Correo Americano del Sur, en esta publicación colaboró con Carlos María de Bustamante.

Para este viaje, Morelos le encargó la custodia de su hijo Juan Nepomuceno Almonte, sin embargo solamente lograron llegar hasta Nueva Orleans.

Por instrucciones del obispo Antonio Joaquín Pérez, impartió cátedra de Filosofía en su alma máter.