En el juicio es condenado a tres años de prisión, pero logra evadirla.
En 1975 se produce la caída de la estructura de ETA(p-m) en Barcelona, y José Manuel Méndez logra escapar del asalto policial y se refugia en Francia.
Una vez en Francia, rompe en 1976 con ETA(p-m) al considerar que su táctica era errónea, y se incorpora a ETA - VI Asamblea (Liga Comunista Revolucionaria) y regresa a Barcelona.
En 1981 comienza a trabajar en distintas empresas de encuestas, organizando las primeras movilizaciones por los derechos laborales de los encuestadores, lo que le supuso entrar en una "lista negra" que le impidió encontrar trabajo en empresas del sector.
En el año 2005 abandona Izquierda Unida al considerar que esta organización estaba tendiendo hacia el reformismo.