José Ignacio Fernández de Alvarado y Perales (Lima, 1723 - 24 de setiembre de 1804) fue un sacerdote criollo que ocupó altos cargos eclesiásticos y académicos en el Virreinato del Perú.
Comenzó su carrera docente como catedrático de Segundas Vísperas (1746), y luego del Maestro de las Sentencias (1747).
Elegido rector de su Universidad (1778), el claustro solicitó autorización del Virrey para que continuase su gestión durante tres años más, para culminar las obras que había iniciado: Ordenó el régimen económico, incorporó la biblioteca jesuita del desaparecido Colegio Máximo de San Pablo, comprobó su inventario y de construir el local donde se la debía instalar.
Como teólogo consultor y procurador del Cabildo Metropolitano, participó en el VI Concilio Provincial Limense (1772).
Destinado al curato de San Vicente de Cañete, a su retorno a Lima alcanzaría las dignidades de tesorero (1802) y chantre (1803) en el cabildo eclesiástico.