Sus padres fueron Juan José de la Peña y María Luisa Navarro.
Se trasladó a Morelia para ingresar al Seminario, recibió una beca por parte del rector Ángel Mariano Morales.
Comenzó a ejercer su ministerio en Morelia e impartió clases en su alma mater.
Poco después, fue cura de Jacona, lugar en el que residió hasta 1840.
Fue obispo auxiliar de Morelia, aunque por diversas circunstancias no llegó a ser consagrado como tal.