Actualmente dirige la octava división de Gimnasia y Esgrima La Plata.
Se afirmó bien en el equipo principal a partir del inolvidable Clausura 1996.
Luego de su paso por Nueva Chicago, en la temporada 2003-2004, donde también fue titular, regresó a Gimnasia para integrar la zaga central y ser un bastión de la gran campaña del Apertura 2005.
En 2006 pasó el récord de Guillermo Sanguinetti de 383 partidos y se convirtió en el jugador récord en vestir la camiseta del Lobo.
En los períodos de 1992-2003 y 2004-2009, Jorge San Esteban disputó un total de 462 partidos para el equipo de Gimnasia y Esgrima La Plata, siendo así el jugador que más veces vistió la camiseta tripera, superando a Guillermo Sanguinetti (1991-2003), Oscar Montañez (1932-1945) y a Enzo Leonardo Noce (1987-2003 y 2004-2005).