Durante la década de los 90 empezó a publicar sus propios trabajos y cosechó rápidamente un gran éxito.
En mayo de 1999, Stroud publicó su primera novela «Buried Fire» que daba comienzo a la carrera de Jonathan como escritor.
Entre sus obras más destacadas se encuentra la Trilogía de Bartimeo.
Una característica especial de estas novelas, comparadas con otras de su mismo género, es que el genio protagonista, Bartimeo, voltea los estereotipos de 'mago bueno' y 'demonio malo' debido a que la saga describe una versión alterna del mundo moderno en el cual los acontecimientos perversos son llevados a cabo por magos corruptos.
Albans, Hertfordshire, con su hija Isabelle y su esposa Gina, ilustradora de libros para niños.