Jonathan-Raphaël Bischoffsheim se casó con Henriette Goldschmidt (1812-1892) en Maguncia el 11 de junio de 1832, con quien tuvo 4 hijos: Clara, Regina, Fernando y Hortense.

Inspiró la política monetaria de la Bélgica independiente, financió préstamos públicos y privados y participó en la creación de numerosas empresas.

Fue concejal municipal de Bruselas (1848) y senador desde 1868 hasta su muerte.

También hizo donaciones a organizaciones benéficas judías y fue miembro del Consistorio Central Israelita de Bélgica.

Tras su muerte, sus herederos donaron parte de su fortuna a causas benéficas en Bélgica.