Se desempeñó dos veces como alto funcionario de las Naciones Unidas.
Desde 2005 hasta 2011 fue representante Especial del Secretario General de las Naciones Unidas para los Derechos Humanos y Empresa.
En esa condición, produjo los Principios Rectores sobre las Empresas y los Derechos Humanos de las Naciones Unidas.
Ruggie ha publicado un libro sobre la base de esta experiencia, titulado Just Business : Multinaational Corporations and Human Rights (WW Norton, 2013).
Kofi Annan, dijo al respecto: «Negocios y problemas de derechos humanos se convirtieron permanentemente en la agenda política mundial hace veinte años, sin embargo, no existe un marco universalmente aceptado para tratar o reducir los daños los derechos humanos en la empresa John Ruggie aceptó el desafío.. para llenar ese vacío y ha logrado mucho en un corto espacio de tiempo.