Nació en Wurzburgo, era hijo de Melchior Friedrich, conde de Schönborn-Buchheim (1644-1717), y su esposa María Anna Sophia von Boineburg (1652-1726).
Su padre era hermano de Lothar Franz von Schönborn, quien fue arzobispo elector de Maguncia.
Luego estudió en la Universidad de Wurzburgo, la Universidad de Maguncia y en Roma, estudios que completó en 1693.
Fue admitido en el cabildo catedralicio de Wurzburgo en 1699.
Falleció de un ataque cardíaco en 1724.