Brandt nació en Jüterbog y fue educado en un Gymnasium de Wittenberg y en la Universidad Humboldt de Berlín.
Brandt animó la colección de animales nativos, muchos de los cuales no estaban representados en el museo.
Empezaron a llegar muchos ejemplares de las expediciones de Nikolái Alekséyevich Sévertsov, Przewalsky, Middendorf, Schrenck y Radde.
Describió diversas aves recogidas por exploradores rusos de la costa del Pacífico de América del Norte, incluyendo Phalacrocorax penicillatus , Antagalla brevirostris y el éider de Fischer.
La abreviatura Brandt se emplea para indicar a Johann Friedrich von Brandt como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.