Estudió teología en la Universidad de Halle.

Se casó con Leopoldine Maria Keller en 1770, con quien tuvo cuatro hijos.

En 1751, se convirtió en pastor en Aschersleben, en Quedlinburg, y más tarde en la Iglesia de San Blasius en Quedlinburg en 1762, y finalmente fue el primer diácono del seminario de Quedlinburg en 1787.

En su faceta científica trabajó con invertebrados acuáticos, particularmente con insectos y gusanos, siendo el primero en observar en el microscopio y describir a los tardígrados en 1773, a los que llamó Kleine Wasser-Bären, que en alemán significa «ositos de agua».

[2]​ En 1784, Goeze percibió las similitudes entre las cabezas de las tenias encontradas en el tracto intestinal humano y las cabezas invaginadas de Cysticercus cellulosae en cerdos.