En su último año de instituto alcanzó el título estatal, tras promediar 24 puntos y 12 rebotes por partido.

[1]​ Durante su primera temporada en la Universidad de Florida jugó poco más de 10 minutos por partido, promediando tan solo 3,9 puntos y 2,7 rebotes por encuentro.

Mejoró notablemente en su segundo año, liderando a su equipo en puntos (14,2 por partido) y tapones (2,4), siendo segundo en rebotes (7,1) por detrás de su compañero Al Horford.

En el torneo de 2006 Noah fue nombrado Jugador más destacado.

Tras un verano difícil en el que se había visto envuelto en asuntos de alcohol y drogas, Noah no llegó en un buen momento, y realizó una primera parte de la temporada pésima.

Terminó la temporada regular a gran nivel y se plantó con su equipo en la primera ronda de los playoffs de la conferencia este, donde esperaban los vigentes campeones: Boston Celtics.

Pero fue en el sexto partido donde Noah se mostró decisivo de veras: con el marcador 123-123, en la tercera prórroga, robó un balón a Paul Pierce y recorrió el campo para acabar con un impresionante mate que se convirtió en un 2+1 y que además significó la sexta falta del jugador de los Celtics.

En julio de 2018 comenzó una relación con la modelo brasileña Lais Ribeiro.