Paganoni comenzó su carrera como jugador en los equipos juveniles del Atlas Fútbol Club.
En dicho encuentro Atlas cayó por marcador de 0-2 ante el frente al Club América.
Llega al Deportivo Toluca Fútbol Club en el draft 2012, y casi a final del torneo cuando sufre una lesión en la pierna izquierda.
En el draft 2014 es contratado por el equipo fresero Club Atlético Irapuato.
Tras una buena temporada con los freseros, regresó a la Primera División jugando con el Veracruz, donde contribuyó en la defensiva para que el equipo mantuviera la categoría, además de llegar a dos liguillas en 2015.