Inmediatamente después trabajó en la sección de Economía del periódico y en 1994 se incorporó a la edición mexicana del diario como jefe de redacción.

En 2003 fue nombrado director del diario económico Cinco Días, editado por el Grupo Prisa.

En febrero de 2007 eligió un comité para emprender la mayor remodelación en los 31 años del periódico.

También se modificó la cabecera al añadirse un acento a la palabra país.

Tras dejar la dirección de El País en 2014, Moreno fue el director-fundador de la Leading European Newspaper Alliance (LENA), que agrupa a ocho periódicos líderes en Europa (Le Figaro, Le Soir, Tages-Anzeiger, Tribune de Genève, Die Welt, La Repubblica, Gazeta Wyborcza y El País).