Dentro del Partido Revolucionario Institucional (PRI) fue vocero del partido y luego fue vocero de la campaña de Francisco Labastida para la presidencia en 2000, ese mismo año fue candidato a diputado federal, sin conseguir el cargo.

[7]​ En agosto de 2017, Lozano renunció a los cargos en el gobierno del estado para volver a su posición como senador y anunció sus intenciones de buscar la candidatura del Partido Acción Nacional (PAN) para la gubernatura.

[8]​ El 9 de enero de 2018, Javier Lozano renunció al PAN por desacuerdos con Ricardo Anaya, exdirigente del partido y precandidato a la presidencia por la coalición Por México al Frente.

Este se presentó como uno de los mayores decomisos en operativos contra el narcotráfico.

[15]​[14]​[16]​ Javier Lozano negó estas acusaciones y dijo que demandaría a Ye Gon, aunque después se desistió.

Y más triste nuestro futuro en manos de políticos como este.".