[1]​ Siglo y medio después cuando hubo paz en la zona, los Iruña decidieron cambiar su lugar de residencia y construyeron una nueva edificación en Vitoria (la actual torre de doña Otxanda), y cedieron su antigua residencia a la orden de los Jerónimos.

Y la ruina total se adueñó del recinto, en la primera guerra carlista fue reconvertido en cuartel de las tropas del pretendiente Don Carlos, siendo quemada posteriormente.

En 1999 el ayuntamiento de Iruña de Oca se hizo cargo del recinto y puso en marcha un plan director con el que se construyó actual jardín botánico, que fue inaugurado en 2003.

En 2015 fue nombrado parque estelar Starlight del mundo, por ser considerado un lugar idóneo para realizar observaciones astronómicas.

-Garcia Fernandez, Ernesto Gobernar la ciudad de la Edad: Oligarquías y elites urbanas en el País Vasco Edit Diputación Foral de Álava, Vitoria- Gasteiz, 2004.