A los 12 años de edad, Whelan tuvo que migrar con su familia hacia los Estados Unidos.
Allí conoció la Orden de Predicadores, a la que ingresó en 1839.
Estudió la filosofía y la teología en el convento de Somerset (Ohio).
[1] Desempeñó los siguientes cargos eclesiásticos: misionero (1846-1852), rector de la St.
Whalen es el autor de Catena aurea : or, A golden chain of evidences demonstrating from "analytical treatment of history," that papal infallibility is no novelty ; a memorial of the Papal jubilee, June 16, 1871 to honor the "Annos Petri completos" of our Holy Father, Pope Pius the Great, una defensa histórico crítica del dogma de la Infalibilidad papal.