Es un agente retirado del FBI y es conocido sobre todo por su rol en la investigación de UNABOM, que dio como resultado el arresto y la condena de Ted Kaczynski.
Fitzgerald se ha mantenido activo en los campos de perfiles criminales y lingüística forense desde que se retiró del FBI, ocupando cargos como profesor adjunto en la Universidad de Hofstra en Hempstead, Nueva York y en la Universidad de Stockton en Pomona, Nueva Jersey.
También continúa trabajando como consultor privado y asesor técnico en producciones de medios, como la serie de televisión Criminal Minds y la película Sleepy Hollow del director Tim Burton.
James Fitzgerald trabajó como productor consultor en la miniserie de Discovery Channel en 2017, Manhunt: Unabomber,[7] que presenta al actor Sam Worthington como James "Fitz" Fitzgerald, descrito por el propio Fitzgerald como "un personaje compuesto" de muchos investigadores en el caso de Unabomber.
Tuvieron tres hijos, Sam, Dan y Ryan.