En 1822 se casa con Deborah Lowe, y en 1824 será admitido como ministro en la Sociedad Religiosa de los Amigos.

Backhouse retoma el vivero, y al fallecer su hermano en 1845, introduce a su hijo James en el negocio.

mantendrá para siempre su obra religiosa, viajando y predicando mucho por Inglaterra, Escocia e Irlanda.

Con Charles Tylor, escribe The Life and Labours of George Washington Walker (1862).

Su hijo, James Backhouse, fue autor de A Handbook of European Birds (1890) y otras publicaciones.