Su último club fue el Miami FC de la USL First Division.

Júnior Baiano inició su carrera a finales de los años 1980 en el Clube de Regatas do Flamengo en el Campeonato Brasileño Serie A, durante los siguientes 15 años, la carrera de Junior lo llevó a Alemania, China y por todo Brasil.

Ganó dos veces el Campeonato Carioca con el Flamengo en 1991 y en 2004.

También ganador de la Copa Conmebol y la Recopa Sudamericana con el São Paulo y la Copa Libertadores con Palmeiras en 1999.

Baiano firmó un contrato con Brasiliense para jugar el Campeonato Brasileño de Serie B en 2007.