Sus exposiciones pretenden difundir el patrimonio marítimo vinculado a la ría de Bilbao y su entorno.Al momento de su quinto aniversario, fue visitado por 323 000 personas, recibió 28 embarcaciones y acogió 21 exposiciones temporales.[4] El museo cuenta con una superficie de 27 000m²,[3] repartidos entre su interior y una explanada exterior donde todavía se conservan los diques del antiguo astillero, además de una grúa restaurada y apodada «la Carola».[5] Ubicada en las gradas del antiguo astillero Euskalduna, instalaciones que forman parte del museo y donde se exponen, de forma libre, barcos y elementos navales.[6] La construcción se hizo a base de perfiles roblonados, uniendo las chapas que forman la estructura mediante tornillos calentados a 900 grados que eran incrustados con un mazo en su correspondiente lugar.La escasa atención prestada por la dirección del museo a esta pieza en cuanto al mantenimiento necesario para su conservación ha llevado al deterioro integral de la misma y a la denuncia de su estado por parte de los antiguos propietarios y a realizar diferentes campañas para lograr su reparación, o en caso de no poderla llevar a cabo, un final digno para la embarcación.
Vista aérea del museo y alrededores
Exposición exterior
Sección dedicada a las traineras en el interior del museo