Cuenta con abundantes pesquerías y da nombre a la provincia de Issyk-Kul.

El gran monje-estudioso budista chino Xuanzang pasó por este lago y anotó los detalles en el cuaderno de viaje clásico Grandes registros Tang sobre las regiones occidentales en el siglo VII.

El nivel del lago es unos 8 metros (8,7 yd) más alto que en la época medieval.

Los buzos han encontrado restos de asentamientos sumergidos en zonas poco profundas alrededor del lago.

[9]​ Durante la era soviética, el lago se convirtió en un popular destino de vacaciones en su orilla norte.

Se alimenta de manantiales, incluidas muchas fuentes termales y del deshielo.

El fondo del lago contiene el mineral monohidrocalcita: uno de los pocos depósitos lacustres conocidos.

[12]​ La orilla sur del lago está dominada por la escarpada y hermosa Cordillera Teskey Ala-Too de las montañas Tian Shan.

Las laderas norteñas de la cordillera son largas y envían un caudal considerable a Issyk-Kul.

El Kungey Alatau del Tian Shan corre paralelo a la orilla norte.

Por lo tanto, los ríos que nacen en ellas son relativamente pequeños y no tienen la oportunidad de fluir juntos para formar sistemas hidrográficos más grandes.

En consecuencia, desembocan por separado en Issyk-Kul o en el río Tüp que fluye a lo largo de la cordillera.

Para ello, la India ha propuesto contratar a empresas locales con conocimientos en tecnología de torpedos para seguir desarrollando la instalación.

Otras siete especies endémicas están casi con toda seguridad amenazadas como capturas accesorias o se ven indirectamente afectadas por la actividad pesquera y los cambios en la estructura y el equilibrio de la población de peces del lago.