En los últimos años se ha destacado por sus posiciones críticas con el fundamentalismo islámico y las interpretaciones ortodoxas del Corán.
El New York Times la ha descrito como "la peor pesadilla de Osama bin Laden".
También interviene a menudo en el programa de debate televisivo Friendly Fire.
Recibió el primer Premio Anual Chutzpah Oprah por su coraje, audacia y convicción.
Manji ha intervenido en numerosos foros internacionales Women’s Forum Leadership Conference, la Asia-Pacific Economic Cooperation Conference on Technology, Learning and Culture et le Los Angeles Committee on Foreign Relations.