Sus actividades son construidas en estrecha articulación con las Redes Y Grupos Técnicos del Consejo Suramericano de Salud.

Las tres funciones básicas del ISAGS son: gestión y producción del conocimiento; desarrollo de líderes; y asesoramiento técnico, que son desarrolladas de forma participativa, tanto para la identificación de problemas como para el encaminamiento y la coparticipación en soluciones.

Tras su creación, ISAGS ya he realizado 6 talleres y apoyó encuentros que resultaron en concertaciones políticas en foros internacionales.

Los talleres son transmitidos en versión trilingüe y después convertidos en clases de video abiertas.

A la Dirección Ejecutiva le cabe la gestión del Instituto de acuerdo con sus objetivos, funciones, políticas, planes, programas y proyectos determinados y aprobados por el Consejo Directivo.

El Consejo Consultivo, a quien compete formular recomendaciones relativas a la planificación, gestión, ejecución y evaluación de los programas desarrollados por el Instituto, está conformado por: