La sede de la oficina se traslada luego a Florencia en 1865, al mismo tiempo que se designa la ciudad toscana como capital de Italia, ciudad que sigue manteniendo actualmente la sede del instituto.

Con la unificación se reconoció la necesidad de que el Estado italiano adquiriera una cartografía nacional unitaria, y en 1872 el Gobierno de la época encomendó, mediante una ley especial, la tarea al Instituto topográfico militar, creado de la transformación del cuerpo militar.

Este instituto, rebautizado como Instituto Geográfico Militar en 1882, se hizo cargo del territorio estatal, formando el nuevo Mapa Topográfico de Italia a escala 1:100.000.

Durante el fascismo, la IGM apoyó los procesos de italianización realizados hacia la toponimia de las lenguas no italianas presentes tanto en el territorio nacional como en las colonias italianas.

La Oficina Documental de Florencia, bajo el mando de un coronel, tras la suspensión del servicio militar, realiza principalmente actividades documentales dirigidas al personal que ha terminado el servicio militar, información y servicio para otras instituciones como el I.N.P.S.